VALIDASI PENAMBATAN MOLEKUL UNTUK MENDAPATKAN LIGAN AKTIF PADA RESEPTOR CYCLOOXYGENASE 2

Authors

  • Okta Nursanti Fakultas Farmasi Militer, Universitas Pertahanan, Republik Indonesia

DOI:

https://doi.org/10.47701/sikenas.v0i0.1280

Abstract

Dalam proses mendesain obat banyak hal yang harus diperhatikan serta dalam
pelaksanaanya membutuhkan waktu yang panjang dan kompleks juga membutuhkan biaya yang
cukup besar dalam proses pengerjaanya. hal ini memberikan ketertarikan terhadap peneliti untuk
dapat menghasilkan metode yang lebih mudah dan efisien yaitu dengan tehnik kimia komputasi l
(Molecular Docking) . Penelitian ini dilakukan untuk mempelajari interaksi senyawa bioaktif
flavonoid dengan target reseptor cyclooxygenase 2 yang di unduh dari Protein Data Bank dengan
kode 1EQG sebagai reseptor anti inflamasi. Untuk mengetahui besarnya interaksi senyawa
bioaktif dengan target dilakukan dengan penpisan virtual melalui Protox II Webs Server untuk
mengetahui toksisitas, PkCSM untuk mengetahui ADMET suatu senyawa dan penambatan molekul
(molecular docking). Perangkat lunak penambatan molekul yang digunakan adalah Arguslab
versi 4.0.1. Pada arguslab menggunakan validasi kombinasi ArgusDock-Dock-Flexible
menghasilkan RMSD 1.4870 Angstrom dan Gadock-Dock-Flexible menghasilkan RMSD 2.372
untuk visualisasi hasil menggunakan Discovery Studio 2016 dengan hasil ikatan asam amino
sama dengan redocking, dari hasil penambatan molekul (Molecular Docking) menunjukan bahwa
delapan senyawa uji aman dan baik setelah uji ADMET, Binding Energy dari Linolol,, Limonen,
Cineol, Pinen, Borneol, Citral lebih tinggi dibandingkan dengan ligan alami Ibuprofen pada
RMSD < 2 Angstrom, tetatapi ada dua ligan yang mendekati binding energy ibuprofen yaitu
Cyclohexen dengan binding energy -9.0508 dan Zingeron dengan binding energi -8.6427 sehingga
mempunyai aktifitas yang baik untuk berikatan dengan reseptor cyclooxygenase 2.
Kata kunci : Kimia Komputasi (docking), Protox II Web Server, PkCSM, Molekular Docking,
Arguslab, Discovery Studio, Anti Inflamasi

Downloads

Published

2021-06-19

Issue

Section

Articles