IDENTIFIKASI MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS DENGAN UJI XPERT MTB/RIF PADA FORMALIN-FIXED PARAFFIN EMBEDDED (FFPE) TUBERKULOSIS EKSTRAPARU

Authors

  • Fairuz Fairuz Fakultas Kedokteran dan Ilmu Kesehatan Universitas Jambi
  • humaryanto humaryanto Fakultas Kedoketran dan Ilmu Kesehatan Universitas Jambi

DOI:

https://doi.org/10.47701/infokes.v13i2.3119

Keywords:

Mycobacterium Tuberculosis, Xpert MTB/RI, Formalin-Fixed Paraffin Embedded, Tuberkulosis Ekstra Paru

Abstract

Tuberkulosis ekstra paru (TBEP) adalah suatu penyakit yang disebabkan oleh Mycobacterium tuberculosis  (MTB)  dijaringan diluar paru, yang secara mikroskopis banyak menyerupai infeksi kronis oleh penyebab yang lain. Di negara-negara berkembang, identifikasi TBEP pada sampel jaringan yang ditanam dalam bentuk Formalin-Fixed Paraffin Embedded (FFPE) merupakan sebuah tantangan dan sampai saat ini terdapat upaya bersama untuk mengevaluasi diagnostik molekuler baru untuk mendiagnosis keberadaan infeksi bakteri MTB  dalam berbagai sampel. Uji XpertMTB/RIF adalah salah satu teknologi yang paling mendukung dalam mendeteksi MTB. Tujuan kami adalah untuk gambaran  identifikasi MTB dengan uji Xpert MTB/RIF   untuk diagnosis TBEP pada jaringan FFPE yang diproses secara rutin. Dilakukan pemeriksaan histopatologis 43 jaringan FFPE dari kasus rutin dugaan klinis TBEP yang disimpan di laboratorium patologi anatomi  dari Rumah Sakit di provinsi Jambi tahun 2018-2020, kemudian dilakukan uji Xpert MTB/RIF, bersamaan dengan pewarnaan Ziehl–Neelsen (ZN) pada sampel FFPE. Ditemukan ebanyak 43 sampel jaringan manusia FFPE dari beberapa jenis organ yaitu kelenjar getah bening (n=31), tulang (n=2), ovarium (n=1), payudara (n=4), testis (n=2 ), parotis ( n=1), usus besar (n=1) dan jaringan lunak (n=1). Pewarnaan Ziehl Nielsen positif untuk MTB pada 41,9% kasus, dan uji Xpert MTB RIF positif untuk TB pada 55,8% kasus. Kesimpulan: Uji Xpert MTB RIF berpotensi menjadi alat yang berguna untuk diagnosis TB pada jaringan FFPE rutin, namun tidak cukup akurat yang diduga disebabkan kerusakan materi DNA pada  FFPE.

Downloads

Download data is not yet available.

References

Bates M, Shibemba A, Mudenda V, Chimoga C, Tembo J, Kabwe M, et al.(2016). Burden of respiratory tract infections at post mortem in Zambian children. BMC Med 2016;14:99.

Bates M, Zumla A. The development, evaluation and performance of molecular diagnostics for detection of Mycobacterium tuberculosis. (2016). Expert Rev Mol Diagn 2016;16:307-22.

Chanda-Kapata P, Kapata N,

Klinkenberg E, Mulenga L, Tembo M,

Katemangwe P, et al. (2015). Non-tuberculous mycobacteria (NTM) in Zambia: Prevalence, clinical, radiological and microbiological characteristics. BMC Infect Dis;15:500.

Cortez M, Oliveira CM, Monte RL, Araújo JR, Braga BB, Reis DZ, et al.(2013). HIV-associated tuberculous lymphadenitis: The importance of polymerase chain reaction (PCR) as a complementary tool for the diagnosis of tuberculosis – A study of 104 patients. An Bras Dermatol;86:925-31.

Dusthackeer A, Sekar G, Chidambaram S, Kumar V, Mehta P, Swaminathan S. (2015). Drug resistance among extrapulmonary TB patients: Six years experience from a supranational reference laboratory. Indian J Med Res;142:568-74.

Kementerian Kesehatan RI. (2015). Pedoman Jejaring dan Pemantapan Mutu Laboratorium Tuberkulosis. Jakarta : Kementerian Kesehatan R

Lawn SD, Kerkhoff AD, Burton R, Schutz C, van Wyk G, Vogt M, et al.(2015). Rapid microbiological screening for tuberculosis in HIV-positive patients on the first day of acute hospital admission by systematic testing of urine samples using Xpert MTB/RIF: A prospective cohort in South Africa. BMC Med;13:192

Maurya AK, Kant S, Nag VL, Kushwaha RA, Kumar M, Dhole TN. (2013). Comparative evaluation of IS6110 PCR via conventional methods in rapid diagnosis of new and previously treated cases of extrapulmonary tuberculosis. Tuberk Toraks;59:213-20.

Pascal Polepole, Mwila Kabwe, Mpanga Kasonde, et al.(2017). Performance of the Xpert MTB/RIF Assay in the Diagnosis of Tuberculosis in Formalin‐fixed, Paraffin‐embedded Tissues. The Int J of Myc;6:83-3

Rie A, Page-Shipp L, Mellet K, Scott L, Mkhwnazi M, Jong E, et al.(2013). Diagnostic accuracy and effectiveness of the Xpert MTB/RIF assay for the diagnosis of HIV-associated lymph node tuberculosis. Eur J Clin Microbiol Infect Dis;32:1409-15.

Rindi L, Alì G, Fabiani B, Fontanini G, Garzelli C.(2017). Detection of Mycobacterium tuberculosis from paraffin-embedded tissues by GeneXpert MTB/RIF. Tuberculosis. ;106:53-5.

Surat G, Wallace WA, Laurenson IF, Seagar AL.(2014)Rapid real-time PCR for detection of Mycobacterium tuberculosis complex DNA in formalin-fixed paraffin embedded tissues: 16% of histological ‘sarcoid’ may contain such DNA. J Clin Pathol;67:1084-7.

World Health Organization (WHO). (2013). Automated real-time nucleic acid amplification technology for rapid and simultaneous detection of tuberculosis and rifampicin resistance: Xpert MTB/RIF assay for the diagnosis of pulmonary and extrapulmonary TB in adults and children: Policy update. In: Automated Real-time Nucleic Acid Amplification Technology for Rapid and Simultaneous Detection of Tuberculosis and Rifampicin Resistance: Xpert MTB/RIF Assay for the Diagnosis of Pulmonary and Extrapulmonary TB in Adults and Children: Policy Update. 16th ed. Geneva: WHO

World Health Organization.(2018).Global Tuberculosis Report 2018. Geneva: WHO;

Zov AG, Koch J, Hamilton-Dutoit SJ. (2015). Improved diagnosis of mycobacterial infections in formalin-fixed and paraffin-embedded sections with nested polymerase chain reaction. APMIS ;113:586-93.

Downloads

Published

2023-09-27

How to Cite

Fairuz, F., & humaryanto, humaryanto. (2023). IDENTIFIKASI MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS DENGAN UJI XPERT MTB/RIF PADA FORMALIN-FIXED PARAFFIN EMBEDDED (FFPE) TUBERKULOSIS EKSTRAPARU. Infokes: Jurnal Ilmiah Rekam Medis Dan Informatika Kesehatan, 13(2), 78–82. https://doi.org/10.47701/infokes.v13i2.3119